Vi sinh vật và các kiểu dinh dưỡng

| Nhóm ví dụ | Kiểu tế bào | |---|---| | Vi khuẩn, Archaea | Nhân sơ | | Nấm men, nhiều vi tảo và động vật nguyên sinh | Nhân thực | Kích thước nhỏ không đồng nghĩa tất cả vi sinh vật đều là tế bào nhân sơ. Nhiều loài trao đổi chất và tăng số lượng nhanh khi điều kiện phù hợp, nhưng tốc độ còn phụ thuộc loài, nhiệt độ, dinh dưỡng và môi trường.

Xác định kiểu dinh dưỡng bằng hai câu hỏi độc lập: 1. Năng lượng đến từ ánh sáng hay phản ứng hóa học? 2. Nguồn carbon chủ yếu là CO₂/carbon vô cơ hay chất hữu cơ? Có ánh sáng chưa đủ để kết luận tự dưỡng; biết dùng CO₂ cũng chưa cho biết nguồn năng lượng.

| Nguồn năng lượng | Nguồn carbon chủ yếu | Kiểu dinh dưỡng | Ví dụ | |---|---|---|---| | Ánh sáng | CO₂ hoặc carbon vô cơ | Quang tự dưỡng | Vi khuẩn lam, nhiều vi tảo | | Oxy hóa chất vô cơ | CO₂ hoặc carbon vô cơ | Hóa tự dưỡng | Một số vi khuẩn nitrate hóa | | Ánh sáng | Chất hữu cơ | Quang dị dưỡng | Một số nhóm vi khuẩn | | Phản ứng hóa học từ chất hữu cơ | Chất hữu cơ | Hóa dị dưỡng | Nấm men, nhiều vi khuẩn | Phân loại dựa vào nguồn **thực sự được sử dụng**, không chỉ dựa vào nơi sống hoặc một chất có mặt trong môi trường.

Vi sinh vật dùng nguyên liệu và năng lượng để tổng hợp thành phần tế bào. Một số loài phải nhận thêm chất không tự tổng hợp được, nên không phải mọi loài đều sống trên cùng môi trường tối thiểu. Enzyme ngoại bào có thể phân giải đại phân tử thành chất nhỏ để hấp thu. Chất nhỏ sau đó được hô hấp, lên men hoặc dùng cho sinh tổng hợp bên trong tế bào; phân giải ngoại bào không có nghĩa toàn bộ quá trình tạo ATP diễn ra bên ngoài.

| Phương pháp | Thông tin chính | Giới hạn cần nhớ | |---|---|---| | Kính hiển vi, nhuộm | Hình dạng, kích thước, cấu trúc trong giới hạn phân giải | Hình dạng hoặc màu Gram chưa đủ định danh mọi loài | | Phân lập và nuôi cấy | Tạo quần thể thuần phù hợp để nghiên cứu | Một khuẩn lạc có thể bắt nguồn từ một tế bào hoặc một cụm tế bào | | Phân tích sinh hóa | Khả năng chuyển hóa trong điều kiện thử | Cần phối hợp dấu hiệu khác để định danh | | Phân tích vật chất di truyền | Bổ sung bằng chứng về quan hệ và định danh | Kết luận phụ thuộc mẫu, marker và phương pháp | Khuẩn lạc là tập hợp tế bào phát triển tại một vị trí, không phải một tế bào khổng lồ.