Phổ khối lượng và phân tử khối

Trục ngang biểu diễn m/z; trục đứng biểu diễn cường độ tương đối. Peak có cường độ lớn nhất được quy ước 100% gọi là **peak base**. Peak base là ion bền hoặc được tạo nhiều trong điều kiện đo, không nhất thiết là ion phân tử. Các peak khác có thể đến từ mảnh vỡ hoặc đồng vị.

Khi phân tử M mất một electron mà chưa vỡ mảnh, ion phân tử thường kí hiệu $\mathrm{M^{+\bullet}}$. Nếu ion mang điện tích +1 thì: $$m/z\approx M_r.$$ Ví dụ, ion phân tử của ethanol xuất hiện ở m/z = 46, phù hợp với $M_r=46$. Trong bài tập cơ bản, đề thường chỉ rõ peak ion phân tử [M⁺]. Không mặc định peak cao nhất là [M⁺]; các peak khác có thể do mảnh ion hoặc đồng vị tạo ra.

Ion phân tử có thể vỡ thành các ion nhỏ hơn. Kiểu phân mảnh phụ thuộc cấu tạo, vì vậy các peak mảnh giúp phân biệt những chất có cùng phân tử khối. Ở mức cơ bản, cần xác định đúng peak ion phân tử từ dữ kiện đề cho rồi mới suy ra phân tử khối. Dữ liệu mảnh ion có thể giúp phân biệt các chất cùng phân tử khối, nhưng không cần tự suy cơ chế phân mảnh khi đề không yêu cầu.