Xử lí nước sau nuôi: chuyển hóa khác với chuyển chỗ

Nước sau nuôi có thể mang thức ăn dư, phân, xác sinh vật, chất hòa tan và tác nhân liên quan. Bùn đáy và phần rắn cần được quản lí cùng dòng nước, không chỉ quan sát màu. Lắng, lọc giúp tách một phần vật chất; xử lí sinh học sử dụng hoạt động sinh vật để phân giải hoặc chuyển hóa những thành phần phù hợp. Các công việc có thể được kết hợp trong một hệ thống. Tách phần rắn không tự loại hết chất hòa tan; chất hữu cơ được chuyển hóa không có nghĩa mọi nitrogen, mầm bệnh và dư lượng đều đã biến mất. Cần kiểm tra đầu ra theo mục đích sử dụng hoặc yêu cầu xả thải áp dụng.

Vi sinh vật phù hợp có thể hỗ trợ phân giải chất hữu cơ và chuyển hóa chất. Thực vật, tảo hoặc hệ động–thực vật thích hợp có thể hấp thụ, sử dụng một phần vật chất; các loài lọc ăn còn có thể sử dụng sinh vật phù du theo thiết kế. Hiệu quả phụ thuộc loài, mật độ, chất nước, oxygen và tải cần xử lí. Không tự thả thêm loài ra nguồn nước để “làm sạch”. Sinh khối tạo ra cần được quản lí; sinh vật dùng trong xử lí nước không tự trở thành thực phẩm an toàn. Chỉ chuyển nước ô nhiễm sang nơi khác hoặc pha loãng để bớt màu không đồng nghĩa đã xử lí đầy đủ.